사이클롭스

스캇은 크리스토퍼 서머스 공군소령의 첫째 아들이다. 스캇이 어렸을 때, 일가족은 개인비행기로 휴가를 떠났으나, 시아(Shi'ar) 행성의 우주선이 공격하여 비행기가 추락할 위기에 처했다. 비행기에는 낙하산이 하나 뿐이 없었고, 서머스 부부는 스캇과 알렉스, 두 아들을 낙하산에 함께 묶어서 탈출시켰다.
서머스 부부는 당연히 죽었을 것으로 생각했지만, 그들은 시아에게 포로로 잡혀갔다. 서머스 소령만 살아남아 나중에 우주해적 스타재머스(Starjammers)의 지도자인 콜세어가 되었다.

스캇은 낙하산이 착륙할 때 뇌손상을 당하는 바람에 일 년간 병원에서 혼수상태로 누워있었고 알렉스는 고아원으로 보내졌다. 결국 깨어난 스캇은 알렉스와는 다른 고아원으로 보내졌고, 사춘기 무렵이 되었을 때엔 심한 두통과 눈의 피로로 고생하기 시작했다. 의사는 그가 루비 석영으로 만들어지는 렌즈를 착용하면 안정된다는 것을 발견했다. 나중엔 눈에서 빔까지 나오게 되어 고생을 했다.

찰스 자비에 교수와 FBI 요원 프레드 던컨이 그를 찾아내어, 스캇은 자비에의 학생이 되었다. 자비에는 자신이 가르치는 뮤턴트 학생들을 X-멘이라는 이름의 팀으로 만들어 인간과 뮤턴트가 평등하게 살아가는 사회를 만들 수 있도록 노력했다. 스캇은 사이클롭스라는 이름으로 자비에 다음가는 X-멘의 리더가 되었고, 유일한 여학생인 진 그레이에게 반했다. 그러나 너무 수줍어서 자신의 감정을 표현하지 못했다. 팀메이트인 엔젤 역시 진 그레이에게 반해 있었다.
사실 진 그레이도 사이클롭스를 좋아했지만 감정을 숨기고 있었다. 둘은 오랜 시간이 지난 후에야 서로의 감정을 확인하고 데이트를 시작할 수 있었다.

자비에 교수가 죽은 것으로 잘못 오인되었을 때, 던컨 요원은 X-멘을 해체시켰다. 매그니토(사실은 가짜 로봇)이 여러 뮤턴트들을 샌프란시스코로 데려가자, X-멘이 이들을 막으려 했지만 압도적인 수에 밀려 지고 말았다.
사이클롭스는 에릭 더 레드(Eric the Red)라는 가명으로 그 조직에 들어가서 매그니토의 부관 자리에까지 올랐다. 덕분에 X-멘은 안팎으로 협공해서 조직을 무너뜨릴 수 있었다.

사이클롭스는 동생 알렉스와 재회했고, 새로운 X-멘 멤버들이 들어와 최초의 멤버들이 팀을 나갔을 때에도 남아서 새로운 팀을 이끌었다.
우주의 존재 피닉스 포스가 진 그레이를 바다 아래 고치로 만들어 가라앉히고, 모습과 기억 등 모든 것을 흡수한 피닉스라는 이름으로 나타났다. 사이클롭스는 이 진 그레이가 진짜인줄 알고 있었으나, 인간의 감정을 갖고 혼란스러워진 피닉스는 결국 우주에서 자살해버렸다. 사이클롭스는 너무 슬퍼한 나머지 X-멘을 떠나 혼자 여행하다가 매그니토와 얽힌 문제로 인해 다시 돌아왔다. 그 후, 아버지가 콜세어라는 이름의 우주해적으로 생존해있음을 알고 동생 알렉스와 함께 재회했다.

사이클롭스는 진 그레이와 너무도 닮은 매들린 프라이어라는 여성을 만나 충격을 받았다. 사실 매들린은 유전학자인 미스터 시니스터가 만든 진의 클론이었다. 그의 계획대로 매들린에게 빠진 사이클롭스는 결국 그녀와 결혼했다. 그는 매들린에게 평범한 생활을 누리게 하려고 X-멘을 떠나 앵커리지에 살림을 차렸다.
미래에서 온 레이첼 서머스가 사이클롭스의 앞에 나타났다. 레이첼은 사이클롭스와 진 그레이 사이에서 태어난 딸이지만, 이 세계에서는 진 그레이가 죽고 아버지는 다른 여성과 결혼했음을 알고 놀랐다. 그녀는 사이클롭스의 결혼생활을 방해하지 않으려고 자신의 정체를 비밀로 했다.

얼마 뒤, 매들린은 임신을 했고 네이든이라는 아들을 낳았다.
사이클롭스는 점점 진 그레이를 그리워하기 시작했고, 매들린과의 사이는 멀어졌다. 진짜 진이 살아있는 채로 발견되자, 그는 매들린과 네이든을 떠나 진을 비롯한 다른 최초의 X-멘 멤버들과 함께 X-팩터라는 새로운 팀을 결성했다. 시니스터의 계획에 따라, 매들린은 미쳐서 진 그레이와 싸우다 죽었다.
나중에 네이든이 테크노 오가닉 바이러스(온몸이 기계로 변하는 바이러스)에 감염되자, 사이클롭스는 치료할 수 있는 기술을 보유한 30세기의 미래로 보냈다. 자비에 교수가 스타재머스와 함께 돌아온 후에, 사이클롭스도 X-멘에 돌아왔고 스톰과 공동으로 리더가 되었다. 사이클롭스와 진은 마침내 결혼했다. 신혼여행 기간 동안 그들은 미래로 가서 네이든을 훈련시키고 돌아왔다. 네이든은 그 시대의 가장 위대한 히어로인 케이블이 되었다.

자비에가 다시 X-멘을 떠나자, 사이클롭스가 전임 리더가 되었다.
최초의 뮤턴트라는 강력한 아포칼립스에 대항하는 사이보그들인 맨나이츠(Mannites)를 돕던 사이클롭스 부부는 아포칼립스가 흡수하려던 케이블을 구했다. 대신 사이클롭스가 흡수되어 죽은 것처럼 보였다.
케이블은 한동안 아버지를 대신해서 X-멘에서 활동하다가 진과 함께 X-멘을 떠나 사이클롭스를 찾아다녔다. 그들은 이집트에서 아포칼립스와 합체한 사이클롭스를 만나 그들과 싸웠다. 진은 정신능력으로 사이클롭스의 몸에서 아포칼립스를 떼어낼 수 있었고, 케이블이 아포칼립스를 물리쳤다. 사이클롭스는 잠시 팀을 떠나 아버지를 만나고 돌아왔다.

그 후, 자비에, 비스트, 울버린, 진과 함께 자비에 교육원을 다시 열었다.
사이클롭스는 어린 뮤턴트들의 교육과 훈련을 돕는 일을 하면서 성격에 격렬한 변화가 생겼다. 이 변화는 진과의 사이가 벌어지는 원인이 되었다. 그는 자살하려던 강력한 뮤턴트 손(Xorn)을 데려왔다. 손과 가까운 사이가 되었고, 진을 좋아하는 울버린과도 계속해 온 임무 덕에 약간의 우정이 싹텄다.
진에게 피닉스 포스의 상징이 다시 나타나기 시작하자, 둘 사이의 거리는 더 벌어졌다. 피닉스 포스의 부분을 위해서 진은 사이클롭스와의 텔레파시 교류를 거부하고, 그를 은근히 경멸하기 시작했다. 피닉스 포스는 진이 그의 '약점'이 되는 것에 싫증냈다.

사이클롭스는 아내와의 화해를 시도하는 대신에, 에마 프로스트와 친하게 지냈다. 그들의 관계는 일련의 심리치료로 시작되었지만, 에마는 사이클롭스와 가까워지기 위해 이 상황을 이용했다. 그에게 조언하는 형태로 자신과의 텔레파시 관계를 부추겼다. 진이 이것을 발견했을 때, 사이클롭스는 단지 생각을 서로 나누었을 뿐이라고 주장하며 잘못된 것은 아무 것도 없다고 했다. 그러나 에마의 비웃음은 진과의 대결을 만들어냈다. 진은 에마에게 사이클롭스에 대한 감정을 시인하도록 강요하고, 또한 많은 실패와 죄, 개인적 악행들을 인정하도록 했다.
분노한 사이클롭스는 다시 한 번 진과 대치하고 진은 그의 마음을 읽었다. 진은 마침내 사이클롭스와 에마 사이에 아무런 육체적 접촉이 없었음을 발견했다. 그러나 진은 그 사건 자체가 그들이 실제로 육체관계가 있었던 것과 마찬가지라는 생각을 스스로에게 강요했다.

사이클롭스는 시련이 계속해서 일어나는 것에 대해 심사숙고하기 위해 X-멘을 떠났다.
그는 한동안 전국을 유랑하며 헬파이어 클럽을 보호하고, 울버린과 팬터멕스(Fantomex)와 함께 동료를 유지했다. 그리고 X-멘에 있으면서 불공평한 자리에 있었다고 느끼고, 책임, 기대, 요구에서 도망치려고 애썼다.
울버린과 함께 한 시간 동안에, 그는 진과의 관계가 침체되었음을 느끼고 처음 십대 때의 로맨스 이후로 발전하지 않았음을 깨달았다. 그는 또한 진이 자신의 말을 듣지 않는다고 느꼈으며, 에마의 잘 받아주는 성격에 끌렸음을 고백했다.

그가 X-멘에 돌아왔을 때, 존 서브라임으로 알려진 살아있는 DNA가 매그니토로 위장한 손을 장악하여 X-멘을 공격했다. 피닉스에 완전히 도달한 진은 가짜 매그니토와 대결하다가 죽었다. 진은 죽기 전에 사이클롭스에게 살라고 당부했다. 아내의 죽음으로 인해 괴로운 사이클롭스는 다시 X-멘을 떠나려고 했다.
그러나 대체 미래의 진은 자신의 어두운 미래를 막기 위해 사이클롭스에게 텔레파시를 보내 에마와의 관계를 진전시키도록 했다. 사이클롭스와 에마는 함께 공동교장으로서 자비에 교육원을 재건했으나, 둘의 새로운 관계는 다른 X-멘과의 사이에 문제를 만들었다. 그들은 이 둘이 진의 추억에 몹쓸 짓을 하고 있다고 믿었다. 특히 상처를 받은 레이첼은 진이 죽기 전에 한 아버지의 행동들에 화를 냈다.

사이클롭스는 또한 콜세어즈(Corsairs)라는 학급을 지도했다. 그 팀은 드라이어드, 퀼, 스펙터, 스텝포드 쿠쿠스로 이루어졌다. X-멘은 응급구조와 원조의 역할을 더 해야 할 필요가 있다고 결정되었다. 그리고 이렇게 더 긍정적인 면에서 뮤턴트 능력을 좋은 일을 위해 사용하면서 주목을 얻었다. 사이클롭스는 세계로 더 나가기 위해 팀을 주의해서 골랐다.
이 팀은 브레이크월드(Breakworld)의 오드(Ord)라는 외계인과 마주했다. 그들은 오드를 정복했지만, 그들 중 하나가 오드의 고향의 파괴에 책임이 있을 것임을 알지 못했다.

정체불명의 악당이 공격해와 사이클롭스와 레이첼 등 팀의 몇몇 멤버들을 물리쳤다. 둘은 붙잡혔고, 사이클롭스가 과거에 방문했으나 기억나지 않는 장소로 옮겨졌다. 사이클롭스와 레이첼은 탈출을 시도했는데, 자신들이 붙잡은 이가 기억에 없는 사이클롭스의 막냇동생인 벌칸(Vulcan)이라는 것을 알았다.
자비에는 과거에 벌칸이 X-멘으로 활동하다가 죽은 것으로 여겨져 그의 존재 자체를 기억에서 지웠음을 밝혔고, 사이클롭스는 이에 크게 화를 냈다. 전부터 틈이 벌어져오던 사이클롭스와 자비에의 사이는 이 일을 계기로 갈라서기로 하고, 자비에가 교육원을 떠났다.

에마는 부모님의 죽음, 동생과의 이별, 자신의 능력의 발현에 대한 결합된 트라우마로 인해 어린 스캇이 일종의 정신블록을 만들어내어 안구 블라스트를 완전히 통제하지 못하게 된 것이 아닐까 하는 가능성을 말했다. 에마는 자비에나 진과는 달리, 사이클롭스가 자신에게 진정한 모습을 다 공개하도록 할 수 있었다. 아주 잠시였지만 그는 안구 블라스트를 완전히 통제할 수 있었다. 또한 오드의 브레이크월드에서의 임무 중에 죽었다가 부활하기까지 했다.

스칼렛 위치가 대다수의 뮤턴트들을 없앤 후에 알래스카 쿠퍼스타운에서 처음으로 뮤턴트 아기가 태어나자, 미스터 시니스터의 뮤턴트 테러집단 머로더즈(Marauders)와 반뮤턴트 집단인 퓨리파이어즈(Purifiers)가 서로 아기를 차지하려고 싸웠다.
케이블이 아기를 데려갔다는 것을 알게 된 사이클롭스는 울버린이 이끄는 X-포스를 결성하여 케이블을 추적하고 아기를 데려오도록 했다. 비숍은 이 아기가 자신의 세계인 뮤턴트가 박해받는 암울한 미래를 가져올 존재라고 믿었다. 자비에는 케이블이 아기를 데리고 미래로 도망치도록 하라고 사이클롭스를 설득했다.
케이블이 미래로 텔레포트하는 순간에 비숍이 아기를 향해 총을 쐈고, 빗나간 총알은 자비에의 머리에 맞고 말았다. 사이클롭스는 안구 블라스트로 비숍을 쓰러뜨리고 X-멘의 해체를 선언했다.

사이클롭스와 에마가 가데스(Goddess)라는 이름으로 샌프란시스코를 장악했던 뮤턴트 정신능력자 마스터마인드(마티니크 윈가드)를 물리친 공로로, 세이디 싱클레어 시장은 X-멘이 샌프란시스코에 머물러 달라는 제안을 했다.
그레이말킨 인더스트리즈에 새로운 본부를 구축한 사이클롭스는 전 세계의 뮤턴트들에게, 샌프란시스코는 뮤턴트들의 안전한 피난처이며 누구든지 환영한다고 발표했다. 샌프란시스코 시민들은 X-멘을 환영했지만, 부활한 그레이든 크리드를 비롯한 반뮤턴트 세력들의 뮤턴트에 대한 증오범죄가 일어났다.
사이클롭스와 스톰은 뉴욕의 몰록 터널로 가서 몰록스를 샌프란시스코로 데리러 갔다. 그러나 섀도우 킹이 사이클롭스를 차지하고 X-멘을 죽이도록 조종했다. 스톰은 번개로 쓰러뜨려 섀도우 킹을 몰아낸 뒤에 심폐소생술을 실시했다.

사이클롭스는 먼저 죽이지 않으면 죽임을 당한는다는 태도를 보이기 시작하면서, 비밀작전 팀 X-포스를 구성했다.
그는 팀의 존재를 비밀로 유지하며, 울버린에게 뮤턴트 아기를 죽일 뻔 했던 미스틱을 죽이라고 지시했다. 변신 외계인 스크럴(Skrull) 제국이 샌프란시스코에 침공해왔을 때, 사이클롭스는 변형된 레거시 바이러스를 생화학무기로 사용하라고 명령했다.

매들린 프라이어는 유령으로 돌아와 스스로를 레드 퀸(Red Queen)이라고 부르며 여성들로만 이루어진 뮤턴트 팀 시스터후드(Sisterhood)를 이끌고 X-멘을 공격해왔다. 진 그레이의 묘지를 알아낸 매들린은 울버린이 보관하던 진의 머리카락을 훔쳐서 부활하려고 했다. 사이클롭스는 도미노(Domino)를 고용해서 진의 시신을 파내고 다른 시신과 바꿔치기하도록 시켰다. 이를 모른 매들린은 시신을 자신의 육체로 소유하려고 했으나, 그 능력 수준을 감당할 수 없던 육체는 붕괴되어버리고 말았다.

쿠퍼스타운에서 뮤턴트 신생아가 태어났다는 사실은 사이먼 트라스크(Simon Trask)에 의해 언론에 공개되었다. 그는 도시의 파괴가 이 신생아 탓이라고 대중을 속였다. 공개된 영상은 샌프란시스코에 반뮤턴트 정서를 불러일으켰고, 뮤턴트들은 이에 항의하는 의미에서 폭동을 일으켰다. 사이클롭스는 뮤턴트와 관련된 모든 문제와 논란거리의 책임자라는 역할을 떠맡으며 부정적인 언론과 여론의 포화를 받았다. 트라스크는 자신의 단체 휴머니티 나우!(Humanity Now!)를 억압의 희생자로 보여지게끔 해서 뮤턴트를 억압하는 법을 추진했다.
최고 보안 책임자인 노먼 오스본은 폭동을 중지시키고 사이클롭스와 X-멘을 체포하기 위해서 다크 어벤저스를 출동시키고, 에마에게도 다크 X-멘을 이끌고 오라고 지시했다. 에마는 뮤턴트의 이익을 지키기 위해서 오스본과 손을 잡은 척하고 있었다. 에마는 다크 비스트가 뮤턴트들을 고문하여 그들의 초능력을 웨폰 오메가(Weapon Omega)에게로 옮기는 기계를 만들었음을 알아냈다. 사이클롭스는 매직(Magik)에게 X-포스를 해머의 알카트라즈 섬으로 텔레포트시키고, 다크 X-멘과 다크 어벤저스를 상대하여 체포된 뮤턴트들을 구해냈다.

그 직후, 사이클롭스와 X-멘 내의 과학그룹인 X-클럽은 태평양 연안으로 가서 몇 년 전에 추락한 인공위성 아스테로이드 M(Asteroid M)을 끌어올렸다. 그들은 위성을 유토피아(Utopia)라는 인공 섬으로 만들어서 모든 X-멘과 동료 뮤턴트들을 이곳으로 이주시켰다. 사이클롭스는 기자회견을 열어서, 자신들은 미국을 떠났으며 노먼 오스본과 그의 방법을 거부한다고 발표했다. 매그니토는 사이클롭스에게로 와서 자신과 자비에가 실패한 뮤턴트 종족의 화합을 이루었다고 칭찬하며 X-멘에 합류했다.

케이블과 청소년으로 자란 뮤턴트 아기(호프)가 미래에서 돌아왔다. 사이클롭스는 호프를 노리는 미래에서 온 바스티언(Bastion)을 물리치고 호프를 유토피아로 데려오는 것을 최우선 목표로 삼았다. 나이트크롤러가 목숨을 희생하면서까지 호프를 유토피아로 데려오자, 바스티언은 시간 포털을 열어서 자신이 온 미래세계에서 님로드 센티넬 군단을 쉬지 않고 데려오기 시작했다. 사이클롭스는 X-포스를 미래로 보내서 님로드 공장의 가동을 중단시키는데 성공했다. 그러나 케이블이 X-포스를 다시 현재로 돌려보내느라 자신을 희생하고 말았다.
아버지나 다름없는 케이블의 죽음에 화가 난 호프는 바스티언을 파괴해버리고 사이클롭스를 비난했다. 그는 아들의 남아있는 유해인 왼 팔을 묻었다. 사이클롭스는 X-포스의 모든 행동과 호프의 출생 이후 모든 X-멘의 죽음에 대한 책임을 지고 X-포스를 해산시켰다. 대다수는 그런 그를 용서했지만, 비스트는 나이트크롤러의 죽음과 점점 호전적으로 행동하는 그의 태도를 비난하며 떠났다.

캡틴 아메리카는 지금이 모든 뮤턴트들이 밝은 곳으로 걸어 나올 시기라고 말했다. 사이클롭스는 대통령 훈장을 수상했다. 호프가 돌아온 이후 다섯 명의 새로운 뮤턴트가 출현했고, 이들과 호프는 라이츠(Lights)라는 이름의 팀을 구성하게 되었다.
재벌 2세 소년인 킬고어(Kilgore)와 그의 뉴 헬파이어 클럽은 유토피아로 대규모의 센티넬들을 보냈다. 사이클롭스와 울버린은 섬을 보호하기 위해서 아이들을 대피시킬지 말지를 놓고 의견이 갈렸다. 아이들을 군인으로 키우려는 사이클롭스의 생각에 분노한 울버린은 그와 싸움을 벌였다. 아이들이 결국 센티넬들을 물리치긴 했지만, 울버린은 유토피아를 떠나 웨스트체스터로 가서 학교를 다시 세우기로 했다.

사이클롭스는 최강의 멤버들로 구성된 익스팅션 팀(Extinction Team)을 조직하여 히어로 활동을 벌이며, 뮤턴트는 더 이상 피해자가 되지 않겠다는 메시지를 세계에 전파하기 시작했다. 그들의 첫 도전은 부활한 미스터 시니스터로부터 샌프란시스코를 지키는 일이었다. 미스터 시니스터는 우주의 종족 셀레스티얼스(Celestials)의 일원인 드리밍 셀레스티얼(Dreaming Celestial)을 이용하여 모든 인간을 자신의 클론들로 바꿔놓는 일이었다. X-멘은 그를 물리치고 드리밍 셀레스티얼로부터 지구의 수호자라는 축복을 받았다.

어벤저스는 피닉스 포스가 지나간 모든 곳을 불태우며 지구로 향해 오고 있다는 것을 발견했고, 캡틴 아메리카는 울버린으로부터 호프에 대한 이야기를 들었다. 한편, 사이클롭스는 호프를 거칠게 몰아붙이며 훈련시키고 있었다. 그는 대체 왜 이러냐는 호프의 질문에 대답을 거부했지만 피닉스 포스가 뮤턴트 종족을 부활시킬 것이라 믿고 있었다.
캡틴은 유토피아로 와서 호프를 넘겨달라고 제의했고, 거절한 사이클롭스는 말다툼 끝에 캡틴을 바다로 날려버렸다. 곧바로 쉴드의 헬리캐리어가 모습을 드러내고 안에 타고 있던 어벤저스가 유토피아를 침공하기 시작했다. 혈투 끝에 X-멘은 항복하고 어벤저스는 호프를 잡으려 했다. 그러나 이것은 사이클롭스의 작전이었다. 그는 몇몇 X-멘과 함께 텔레포트하여 도망치고, 호프 역시 울버린과 스파이더맨을 쓰러뜨리고 도망쳐버렸다.

사이클롭스는 레이첼에게 연락해서 어벤저스에게 잘못된 장소를 알려주도록 제공하도록 설득했다. 그는 진 그레이 학교로 찾아와 울버린에게 편을 바꿀 마지막 기회를 주고, 자신과 뜻을 같이 할 동료들을 모집했다. 울버린은 끝내 거절했지만, 몇몇 뮤턴트들은 사이클롭스를 따라갔다.
호프가 울버린과 함께 달로 향하고 있음을 알게 된 사이클롭스는 에마, 매직, 네이머, 콜로서스와 함께 달에 도착해 어벤저스와 맞섰다. 전투가 벌어지기 전에, 피닉스에게 당한 토르가 하늘에서 떨어졌다. X-멘과 어벤저스 간의 싸움이 시작된 사이, 아이언맨은 피닉스에 맞설 무기를 제작해 공격했다. 그러나 피닉스는 사라지는 대신에 다섯 조각으로 나뉘어 다섯 명의 X-멘의 몸으로 들어가 버렸다. 피닉스 파이브라고 불리게 된 이들은 바로 사이클롭스, 에마, 네이머, 매직, 콜로서스였다. 그들은 지구로 돌아갔다.

피닉스 파이브는 전쟁을 불법화하고 물과 음식, 에너지들을 공급해주며 전 세계를 살기 좋은 곳으로 바꾸어갔다.
사이클롭스는 호프를 자신들에 대항할 무기로 키우려는 계획을 두려워해서 “어벤저스는 이제 그만(No more Avengers)”를 선언했다. 그리고 어벤저스와의 싸움에도 불구하고, 같은 피닉스들에게 분노하지 말라고 요구했다.
어벤저스가 와칸다에 숨어있는 것을 알게 된 에마는 네이머에게만 이것을 알려주었다. 네이머는 즉시 아틀란티스 군대를 이끌고 와칸다를 침공했고, 많은 피해를 입힌 끝에 어벤저스에게 패해 물러났다. 네이머에게 깃들어있던 피닉스는 그가 기절하자 그를 떠나 다른 네 명에게 나뉘어 흡수되었다. 이렇게 능력이 증가한 에마는 어벤저스가 호프를 어디로 데려갔는지 감지해낼 수 있었다. 그녀는 사이클롭스에게 호프를 즉시 막으러 가야 한다고 애원했지만 그는 듣지 않았다.

스파이더맨을 잡으려던 콜로서스와 매직이 서로 다투다가 싸우는 바람에 둘다 기절하자, 그들에게 깃들어 있던 피닉스가 사이클롭스와 에마에게로 들어갔다. 막강한 능력을 갖게 된 그는 차원을 통과하여 쿤룬으로 들어가 호프를 찾아냈다. 그리고 모든 어벤저스와 신비의 용인 쇼우라오(Shou-Lao)까지 물리쳐버렸다. 호프는 스칼렛 위치의 마법과 쇼우라오의 능력을 모두 복제하여 사이클롭스를 달로 보내버렸다.
더 많은 힘이 필요하다는 것을 깨달은 사이클롭스는 유토피아로 가서 에마를 찾아 공격하려고 했다. 그러나 자비에가 끼어들어 그 둘의 두뇌를 정지시키려 했다. 어벤저스가 몰려오고 X-멘 역시 사이클롭스와 에마를 멈추게 하려고 힘을 보탰다. 사이클롭스는 에마에게 남아있는 피닉스를 빼앗아 유일한 피닉스가 되었다. 이로 인헤 피닉스에 대한 통제력을 잃은 그는 다크 피닉스가 되어 자비에를 죽여버리고 말았다.
호프와 스칼렛 위치는 그에게서 피닉스 포스를 쫓아내고 “피닉스는 이제 그만(No More Phoenix)!"를 외쳐 소멸시켜버렸다. 덕분에 뮤턴트 종족은 다시 발생하기 시작했다.

피닉스를 잃은 사이클롭스는 체포되어 루비로 만들어진 방에 갇혔다. 미스터 시니스터는 그를 면회가서 비웃고 탈옥해야만 자신을 막을 수 있을 것이라며 괴롭혔다. 사이클롭스는 초능력완충기를 착용한 채로 일반 감방으로 옮겨졌다. 제이크라는 새 뮤턴트 사기꾼과 친구가 되었다. 사이클롭스는 정치적인 이유로 계속 수감생활을 하기로 결정했지만, 뮤턴트 혐오자들에게 제이크가 죽임을 당하자 뮤턴트들을 지키기 위해서 매그니토에게 탈옥시켜달라고 부탁했다. 매그니토, 매직, 데인저(Danger)는 교도소를 부수고 사이클롭스를 구한 뒤에, 제이크의 살해범을 림보로 보내버리고 살인을 사주한 교도소장을 흉하게 만들어버렸다.
데인저는 자신의 길을 가겠다며 떠나고, 사이클롭스와 매그니토, 매직은 뮤턴트를 지키고 세계를 구하기 위해서 힘을 모으기로 했다. 그들이 캐나다에 있는 옛 웨폰X 시설에 본부를 꾸리고 에마를 구출하는 동안에, 사이클롭스와 매그니토는 자신들의 능력을 조절하지 못하게 되었다. 에마는 자신도 마찬가지라면서 피닉스 포스가 망가뜨린 것이라고 말했다. 매그니토는 피닉스가 된 사이클롭스에게 얻어맞았던 일로 조절이 불가능하게 된 것으로 보였다. 사이클롭스는 해결법을 찾겠다고 맹세했다.

또 다른 어린 뮤턴트들을 영입하고 다니던 중에, 과거에서 온 자신을 포함한 다섯 명의 오리지널 X-멘을 만나게 되었다.
어린 진 그레이는 능력의 통제력을 잃고 사이클롭스를 내동댕이쳐버렸다. 그의 바이저가 벗겨지면서 안구 블라스트가 발사되자, 오리지널 X-멘은 자신들을 죽이려 한다고 생각해서 반격했다. 매그니토가 그들을 멈추게 한 뒤에 매직의 능력으로 대피했다. 사이클롭스는 어린 자신을 믿지 못했고, 어린 사이클롭스는 미래의 자신을 괴물이라고 인식했다.
사이클롭스는 어린 뮤턴트들을 “뉴 찰스 자비에의 영재학교”라고 이름붙인 본부에서 훈련시키며 자신의 능력도 통제할 수 있도록 노력했다. 더 많은 뮤턴트들을 구하고 다니면서, 사람들은 그를 혁명가라고 여기기 시작하고, “사이클롭스가 옳았다”라는 문구가 찍힌 티셔츠를 제작하기까지 했다. 이 기간 동안, 그와 에마는 피닉스를 차지하기 위해 공격했던 일에 대해 화해했다. 둘은 서로에 대한 감정을 인정했지만 다시 시작하기엔 힘들다는 것을 받아들였다.

템푸스(Tempus)가 가족을 다시 볼 수 있도록 팀을 데리고 오스트레일리아로 갔지만, 매그니토가 쉴드에게 밀고해서 어벤저스가 그들 앞에 나타나도록 했다. 사이클롭스는 동생 하복이 뮤턴트와 어벤저스의 협력 관계의 대표로 활동하고 있긴 하지만, 여전히 사회와 법률이 뮤턴트들을 차별하며 사냥하고 있다고 지적했다. 그러면서 무죄가 입증되기 전까지 유죄 취급을 당하는 뮤턴트들에 대해 어벤저스가 보호해주고 있지 않다고 주장했다.
호크아이가 그의 머리에 화살을 겨누고 캡틴 아메리카에게 체포하라고 강요했다. 시간조종의 능력자인 템푸스는 타임버블을 만들어서 어벤저스를 그 안에 가두었다. 돌아온 그들은 매그니토가 쉴드의 잠입요원이었음을 알아냈다. 분노한 사이클롭스는 그를 조각조각 내버리려고 했으나 에마가 이를 진정시키고 자신도 매그니토의 방법에 동의한다고 말했다. 처음에 꺼려했던 사이클롭스도 이를 받아들이고 학생들을 데리고 진 그레이 학교를 찾아가기로 했다.

X-멘은 모두 사이클롭스가 미쳤다고 생각하고 있었지만 그가 하는 말을 들어주었다. 사이클롭스는 뮤턴트들은 지금 벼랑 끝에 몰려있으며, 커져가는 반뮤턴트 감정들에 대해 함께 맞서야 한다고 주장했다. 그러면서 자신의 학교에 들어와서 다가올 전쟁에 대비해 스스로를 지키는 훈련을 하자고 제의했다. 울버린과 다른 이들의 항의에도 불구하고, 스테포드 쿠쿠스(Stepford Cuckoos)와 과거에서 온 엔젤이 그를 따라 나섰다.

몇 달 후, 사이클롭스는 뮤턴트를 지키도록 프로그래밍한 센티넬들에게 보호받는 뮤턴트 성지 네이션 X(Nation X)의 지도자가 되었다. 자신의 능력을 다시 제어할 수 있게 된 사이클롭스는 쉴드의 어벤저스에게 쫓기고 있는 비스트(일루미나티의 멤버라는 이유로)를 받아주었다. 선스팟(Sunspot)이 비스트를 찾아왔을 때 사이클롭스는 그를 환영하고 모든 우주의 멸망 인 급습(Incursion) 현상에 대해 이야기를 나누었다. 그는 피닉스 에그(Phoenix Egg)를 갖고 있으며 필요시에 기꺼이 사용하겠다는 이야기를 했다.
그러나 급습이 이미 시작된 상황에서 피닉스 에그는 부화할 준비가 되어있지 않았다. 지구-1610의 군대에 맞서 싸우고 있는 맨해튼의 급습 지점으로 간 사이클롭스는 에그가 부화하자마자 다시 피닉스 포스와 결합하여 지구-1610의 칠드런 오브 투모로우(Children of Tomorrow)와 군대들을 파괴했다. 그러나 지구-1610과의 충돌을 막을 수는 없었다.
결국 텔레포트 능력자인 매니폴드(Manifold)는 사이클롭스와 몇몇 히어로들을 일루미나티의 구명선으로 이동시켰고, 구명선은 멀티버스의 종말에서 살아남을 수 있었다.
이들은 닥터 둠(Doctor Doom)이 창조해 지배하고 있는 배틀월드 행성에 도착했고, 8년 후에 닥터 스트레인지에 의해 깨어났다. 닥터 둠이 이들의 존재를 알고 나타나자, 사이클롭스는 피닉스의 막강한 힘으로 둠에게 맞섰다. 그러나 둠은 사이클롭스의 목을 꺾어서 죽여 버렸다.

미스터 판타스틱이 멀티버스를 복구시키는데 성공하여 사이클롭스는 급습과 이후의 상황에 대한 기억을 잊은 채로 부활했다. 어느 날, 사이클롭스의 X-멘 팀은 뮈어 섬의 구조신호를 받고 날아갔다. 뮤턴트 연구소의 모든 스태프들은 죽어있었고, 고통스러워하는 멀티플맨을 발견할 수 있었다. 멀티플맨은 인휴먼즈가 풀어놓은 인휴먼 변이용 안개인 테리젠 미스트(Terrigen Mist) 구름으로 섬이 뒤덮였으며, 그 구름이 뮤턴트들에게 치명적이라는 것을 알리고 숨을 거두었다.
사이클롭스와 에마는 섬 곳곳을 뒤지며 사태를 파악하고 다녔는데, 이 안개의 영향을 받은 사이클롭스는 급격히 위독해지고 말았다. 쓰러진 그는 에마에게 이렇게 끝나지 않도록 해달라고 간청하며 죽었다. 비통한 에마는 사이클롭스의 죽음을 비밀로 하고 텔레파시로 그의 모습을 만들어냈다.

에마는 이 허상의 사이클롭스가 진짜 그라면 했을 법한 행동과 말을 하도록 만들어서, 자비에 학교의 학생이었던 알케미(Alchemy)라는 뮤턴트를 찾아가 설득했다. 알케미가 테리젠 미스트 구름을 인간, 뮤턴트, 인휴먼 모두에게 무해한 다른 성분으로 변형시키는데 성공하고 죽은 후, 인휴먼즈의 로열 패밀리가 항의하기 위해 이들 앞에 나타났다. 에마가 만들어낸 '사이클롭스'는 블랙 볼트(Black Bolt)에게 맞서서 그의 음파공격에 의해 영웅다운 최후를 맞이했다.
X-멘이 그의 장례식을 치른 후, 에마는 하복을 따로 불러서 진짜 사이클롭스의 시신을 보여주고 진실을 알려주었다.

에마 프로스트의 행동은 뮤턴트와 인간 양쪽 모두가 사이클롭스를 테러리스트로 간주하던 인식을 근본적으로 바꾸어 놓았다. 사이클롭스의 유령들(Ghosts of Cyclops)이라는 이름의 한 무리의 젊은 뮤턴트 극단주의자들은 사이클롭스를 우상화하면서, 그를 기리기 위해 사이클롭스의 바이저를 흉내 낸 마스크를 쓰고 테러를 저질렀다.
미스터 시니스터는 사이클롭스의 DNA를 사용하여 인휴먼과 뮤턴트의 하이브리드 클론을 만들었다. 하지만 클론은 인휴먼쪽 요소가 장악하면서 불안정해졌고, 올드맨 로건에게 패배했다.
인휴먼즈와의 전쟁 중 어린 스캇은 인휴먼 모자이크(Mosaic)에게 일시적으로 빙의되었을 때, 모자이크가 직전에 빙의했던 매그니토의 기억 조각들에 의해 나이 든 자신의 행동과 죽음에 대한 진실을 알게 되었다. 어린 스캇은 다른 X-멘과 인휴먼즈에게 에마의 속임수를 알렸고, 메두사는 테리젠 구름을 파괴했다.

피닉스 포스는 나중에 사이클롭스를 부활시켰다. 역시 되살려낸 진을 호스트로 삼기 위해 설득하려는 계획의 일부였다. 하지만 두 사람 모두 사이클롭스를 되살리지 말았어야 한다는 것을 인정했기 때문에 진은 사이클롭스를 죽일 수밖에 없었다.
과거에서 온 어린 케이블은 개조한 피닉스 케이지(Phoenix Cage) 안에 장례식 당시의 사이클롭스의 시신을 안치하고, 사이클롭스가 잠시 부활했을 때 피닉스 포스로부터 빨아들인 에너지를 이용해서 다시 한 번 부활시켰다.

사이클롭스 코스튬